霉菌性食管炎、全胃炎、十二指腸炎同時伴有艾滋病毒感染，治療較為復雜，涉及抗病毒治療、抗真菌治療、針對炎癥的治療、生活飲食調整以及定期復查等。 1.抗病毒治療：艾滋病毒感染需要長期規范的抗病毒治療，常用藥物如齊多夫定、拉米夫定、依非韋倫等，以抑制病毒復制，提高生活質量，延長生存期。 2.抗真菌治療：對于霉菌性食管炎，可使用氟康唑、伊曲康唑、伏立康唑等抗真菌藥物。 3.炎癥治療：全胃炎和十二指腸炎的治療，可選用奧美拉唑、蘭索拉唑等抑制胃酸分泌的藥物，以及硫糖鋁、枸櫞酸鉍鉀等胃黏膜保護劑。 4.生活飲食調整：保持規律作息，避免勞累和精神緊張。飲食清淡，避免辛辣、油膩、刺激性食物，戒煙戒酒。 5.定期復查：遵醫囑定期復查胃鏡、HIV 相關指標等，以便及時調整治療方案。 綜合治療并積極配合醫生，注意生活中的調養，有助于控制病情，提高生活質量。但治療過程中需密切關注身體變化，如有異常及時就醫。

巴瑞特食管綜合征可為先天性，但常繼發于反流性食管炎，在胃-食管反流的基礎上發生食管炎和潰瘍。為長期慢性胃食管反流的并發癥，由于長期反流，下段食管的鱗狀上皮可被化生的柱狀上皮所代替，患者常有典型的反流癥狀。其中部分患者可發展為食管癌。治療常需外科手術。藥物治療可應用粘膜保護劑硫糖鋁，同時給予h2-受體阻滯劑或質子泵抑制劑。促動力藥普瑞博思對防止食管反流有一定療效，每次5～10mg，每日3次。

萎縮性胃炎只要好好治療還會痊愈.但是發展成重度萎縮治療就會困難得多，癌變的幾率會增加，合并糜爛、hp、潰瘍情況還會嚴重.所以，要抓緊時間治療，防止加重.中藥治療效果不錯，可以逆轉萎縮、腸化、不典型增生的粘膜。西藥沒有很恰當的藥可用.

食道炎其癥狀主要是以吞咽疼痛、困難、心口灼熱及胸骨后疼痛居多。可以服用奧美拉唑腸溶膠囊阿莫西林或克拉霉素甲硝唑進行治療同時服用猴頭菌素片。