藥物可以選擇抗酸劑(氫氧化鋁、鋁碳酸鎂等)、H2受體拮抗劑(如西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁、尼扎替丁)、質子泵抑制劑(奧美拉唑、蘭索拉唑、潘妥拉唑、雷貝拉唑、埃沙美拉唑等)和促胃腸動力劑(如多潘立酮、伊托普地、西沙必利、莫沙必利等)。癥狀與酸反流密切相關者的藥物治療效果較好。其中質子泵抑制劑療效尤為顯著。

藥物治療抗酸劑(氫氧化鋁、鋁碳酸鎂等)、H2受體拮抗劑(如西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁、尼扎替丁)、質子泵抑制劑(奧美拉唑、蘭索拉唑、潘妥拉唑、雷貝拉唑、埃沙美拉唑等)和促胃腸動力劑(如多潘立酮、伊托普地、西沙必利、莫沙必利等)。癥狀與酸反流密切相關者的藥物治療效果較好。其中質子泵抑制劑療效尤為顯著。

　　有燒心癥狀時，可服用抗酸藥如氫氧化鋁片(2—3片，每日3次，餐前1小時嚼碎后服用)、鋁碳酸鎂(0.5～1.0 g，每日 3次，餐后1—2小時、睡前或胃部不適時服用)、復方氫氧化鋁片(2～4片，每日3—4次，飯前半小時或胃痛發作時嚼碎后服)等。如這些藥物不能緩解癥狀，可選用下列藥物。 　　1.功能性燒心的促動力藥 　　多潘立酮10 mg，每日3次，餐前半小時服;枸櫞酸莫沙比利5 mg，每口3次，餐前服用。 　　2.功能性燒心的H2受體阻滯劑 　　西咪替丁400 mg，每日2次，口服;雷尼替丁150 mg，每日2次，口服;法莫替丁20 mg，每日2次，口服。 　　3.PPI 　　奧美拉唑20 mg，每日1次或每日2次，口服;蘭索拉唑30 mg，每日 1次或每日2次，口服;泮托拉唑40 mg，每日1次或每日2次，口服;雷貝拉唑10 mg，每日1次或每日2次，口服;埃索美拉唑20 mg，每日1一2次，口服。