引起霉菌性陰道炎反復發作的原因可以有以下幾方面：
首先，發生霉菌性陰道炎后用藥不認真，不能徹底治療，是導致疾病反復發作的重要原因。霉菌性陰道炎患者經過治療，仍需要在每次月經干凈后去醫院復查婦科檢查及陰道分泌物化驗，連續3次。如果此期間有1次又發現念珠菌感染跡象就不能定為痊愈，而屬于復發或再感染，需要繼續治療。
第二，夫妻雙方未同時接受治療：女性患霉菌性陰道炎后，通過性生活可以將病原體傳給丈夫，使丈夫也成為帶菌者，約10%的男性可發生龜頭包皮炎。如果僅女方治療而男方未治，那么即使女方治愈也會被丈夫再感染，使念珠菌在夫妻雙方間反復“傳遞”，女性的霉菌性陰道炎反復出現。
第三，治療期間未按規定換洗消毒內褲、毛巾，也可以成為念珠菌再感染的原因。
第四，人體自身就可以是念珠菌的攜帶者，存在于腸道中的念珠菌感染陰道時即能引起霉菌性陰道炎，例如平時衛生習慣不良，大便后擦拭外陰時總是由肛門向尿道方向擦，就可能將腸道中的念珠菌帶入陰道，反復引發霉菌性陰道炎。因此，治療霉菌性陰道炎時應該同時口服用藥，以消滅腸道念珠菌。而且，患者要改變不良衛生習慣。
第五，經常或長期使用抗生素，反復破壞陰道菌群間的制約關系，使念珠菌生長旺盛。對這類病人應該在服用抗生素的同時或治療后給予抗霉菌藥物進行預防。
第六，糖尿病患者反復發作霉菌性陰道炎是因為其陰道內酸度增加，以及長期尿糖，為念珠菌的生長提供了有利的條件。因此治療糖尿病是減少霉菌性陰道炎反復發作的關鍵。
第七，不講究衛生，內褲與襪子同洗。
雖然因足癬傳染而引起霉菌性陰道炎者極少，但并不是沒有可能。如果引起足癬的細菌恰是白色念珠菌，那么上述做法就會造成自身傳染。另外，經常使用衛生標準不合格的衛生巾、衛生紙，或有洗盆塘的習慣，也有可能導致反復發生霉菌性陰道炎。

霉菌性陰道炎反復發作首先需要積極尋找原因，根據具體情況治療。霉菌性陰道炎反復發作可能有以下方面的原因：沒有按照規定的時間和療程治療，導致霉菌性陰道炎沒有沉底治愈；長時間使用光譜抗生素，導致菌群失調，霉菌大量滋生；還有可能是患有糖尿病，一些性傳播疾病等等引起。需要針對這些原因來積極治療。