性交疼且陰道有囊腫可能由多種原因引起，如炎癥感染、囊腫壓迫、激素變化、心理因素、陰道結構異常等。 1.炎癥感染：陰道炎癥可能導致局部組織充血、水腫，引起性交疼痛和囊腫形成。常見的陰道炎包括滴蟲性陰道炎、霉菌性陰道炎和細菌性陰道炎。治療需根據具體類型選擇合適的藥物，如甲硝唑、克霉唑、克林霉素等。 2.囊腫壓迫：陰道囊腫較大時會對周圍組織產生壓迫，從而引發疼痛。治療通常需要手術切除囊腫。 3.激素變化：體內激素水平波動，如雌激素減少，可能影響陰道黏膜的彈性和潤滑，導致性交疼和囊腫。可在醫生指導下補充雌激素。 4.心理因素：焦慮、緊張等不良情緒可能導致陰道肌肉痙攣，引起性交疼。心理疏導和放松訓練有助于緩解。 5.陰道結構異常：先天性陰道發育異常或后天損傷導致的結構改變，也可能出現此類癥狀。必要時需進行整形修復手術。 出現性交疼且陰道有囊腫的情況，應及時到正規醫院就診，進行詳細的檢查和診斷，以便采取針對性的治療措施。

有囊腫在性生活的時候是否會疼,那要看囊腫的位置及大小或良性及惡性之分了.建議你到醫院明確下診斷后,在進行治療.但除了腫瘤在性交的時候出現性交痛,但在其他病因的情況下一樣會出現性交痛的.如：性交疼痛可因本身器質性病變引起,如生殖器或附屬性腺的炎癥,生殖器形態的改變或異常.也可由其他疾病繼發形成,如婦女缺乏潤滑等.還可由精神性因素引起,如夫妻關系不和,缺乏性知識,缺乏性前戲等,中醫學認為本病病位主要在肝,腎；病因為稟賦不足,房勞過度,外感濕熱,內傷七情,飲食不節；病機主要為濕熱下注,寒凝肝脈,肝氣郁結,肝腎陰虛.治療參考1,心理治療：包括協調夫妻關系,消除抵觸情緒；進行正確的性教育,克服緊張,恐懼情緒,消除誘發因素.2,藥物治療：生殖器及附屬性器官感染時使用抗感染藥物治療；對陰道萎縮者可使用雌激素等內分泌藥物,也可使用陰道潤滑劑.

陰道囊腫可以引起性交疼.囊腫可能為分節狀或為多數性,囊腫大小不一,一般均為2～3cm直徑,外表光滑,固定,觸之有囊性感.這種囊腫經常較小而無臨床意義,但偶爾可生長很大,而引起性交困難或性交疼痛,甚至阻礙分娩,有時壓迫膀胱三角區,引起小便次數增加.在極少數病例中,其細長索狀的蒂可引起腸管的扭曲和阻塞.囊腫的內容物多為水樣,漿液性或乳白色液體,也有呈深棕色者.其顏色和粘稠度視有無囊內出血和出血量多少而不同.以手術切除為主.如囊腫位置不太高,手術常不困難,但在剝離過程中須注意且勿傷及尿道或膀胱.如果腫瘤大而位于穹窿深部,且向闊韌帶內擴展時,則不可能經陰道將其完整的切除,即使同時經腹部手術,也非常困難.有些作者認為將殘留的囊壁用刮匙刮后,將其殘端的邊緣分別和陰道粘膜切口的相應邊緣縫在一起造口,再用紗條填塞陰道,壓迫殘留囊腔,有可能使殘留的囊壁完全粘連閉合,即使不能粘連閉合,也不致于再充脹起來.