梅毒治療期間扁平濕疣仍增多可能與治療不徹底、再次感染、免疫功能異常、合并其他感染、生活習慣不佳等有關。 1.治療不徹底：梅毒治療需要按照規范的療程進行，如果療程不足或用藥不規范，可能導致病原體未被完全清除，從而使扁平濕疣持續存在甚至增多。 2.再次感染：治療期間若未注意防護，再次接觸梅毒螺旋體，會引起病情反復。 3.免疫功能異常：個體的免疫狀態對疾病的恢復至關重要。若免疫功能低下，機體清除病原體的能力減弱，不利于病情恢復。 4.合并其他感染：如同時存在生殖器皰疹、尖銳濕疣等其他性傳播疾病，會影響梅毒的治療效果。 5.生活習慣不佳：治療期間不注意個人衛生，頻繁性生活，或長期熬夜、酗酒、吸煙等，都可能影響身體的恢復。 總之，梅毒治療期間扁平濕疣增多的原因較為復雜。患者應及時復診，醫生會根據具體情況調整治療方案，并給予相應的生活指導。

如果是梅毒治療沒有效果也可以按尖銳濕疣進行治療的，如用干擾素，胸腺肽等進行治療。