營養代謝性疾病也是小兒癲癇的常見病因：低血糖、糖尿病昏迷、維生素B6缺乏、甲亢等均可引起癲癇發作。小兒癲癇的常見病因還有產傷，造成產傷的原因有產鉗助產、胎頭吸引器吸引、頭盆不稱、胎位異常、胎兒過大、產程過長、初產婦年齡過大、產道緊張等。

外傷和免疫力低下也是小兒癲癇的常見病因：外傷和有些嬰幼兒經常感冒發燒，有時也可引起癲癇。腦發育不全、腦發育遲緩、腦萎縮，各種腦炎、腦膜炎、腦膿腫病人愈后部分人可有癲癇后遺證;腦血吸蟲、腦囊蟲病可引起癲癇，這些都是小兒癲癇的常見病因。

羊水吸入胎兒窒息、臍帶繞頸、胎盤早剝、前置胎盤、臍帶脫垂、剖腹產等都是小兒癲癇的常見病因，日后發病率明顯增加。高熱驚厥后腦損傷也是小兒癲癇的常見病因。不論哪種原因引起的癲癇，積極治療原發病，迅速控制發作，接受正規、合理、無毒副作用的治療是疾病順利康復的保證。先天性因素，腦畸形、腦積水、染色體異常等先天疾病，以及胎兒出生以前在母體內受到的損害都是小兒癲癇的常見病因，它可造成大腦發育異常，生后出現癲癇病發作，如孕婦腹部受傷、子宮出血、紫外線照射、服用對胎兒有害藥物、各種微生物尤其是風疹、麻疹病毒及弓形體感染等。