手足口病是由腸道病毒引起的傳染病。寶寶手足口病5天仍低燒且咳嗽，可能與病毒未清除、繼發感染、身體免疫反應、環境因素、護理不當等有關。 1.病毒未清除：手足口病病程一般為7 - 10天，5天時間可能病毒還處于活躍期，持續引起低燒等癥狀。 2.繼發感染：可能在患病期間繼發了呼吸道感染，從而導致咳嗽。 3.身體免疫反應：寶寶自身免疫系統在對抗病毒過程中，可能會引起體溫調節中樞紊亂，導致低燒。 4.環境因素：如果環境溫度較高或者寶寶衣物穿著過多，可能會使體溫維持在37度左右。 5.護理不當：比如沒有及時補充水分等，不利于病情恢復。對于咳嗽，如果是干咳為主，右美沙芬可緩解癥狀；如果咳嗽有痰，氨溴索、乙酰半胱氨酸可幫助化痰。但一定要遵醫囑使用。 11個月寶寶手足口病5天低燒且咳嗽，要綜合考慮多種因素，必要時帶寶寶到正規醫院兒科進一步檢查，在醫生指導下進行合理的治療。

手足口病是病毒感染導致，應該及時使用阿昔洛韋、利巴韋林等抗病毒藥物治療，咳嗽可以口服小兒止咳化痰顆粒治療，具體治療可以到正規醫院兒科就診做一下血常規等檢查，根據檢查進行治療，多喝水。