自身免疫性疾病有很多種的，分為器官特異性比如慢性甲狀腺炎，1型糖尿病，，還有非特異性比如類風濕性關節炎，系統性紅斑狼瘡。患者血液中可以檢出高滴度的自身抗體和（或）與自身免疫組織成分起反應的致敏淋巴細胞。患者組織器官的病理特征為免疫炎癥，并且損傷的范圍與自身抗體或致敏淋巴細胞所針對的抗原分布相對應。用相同抗原在某些實驗動物中可復制出相似的疾病模型，并能通過自身抗體或相應致敏淋巴細胞使疾病在同系動物間轉移。

自身免疫性疾病有很多種的，分為器官特異性比如慢性甲狀腺炎，1型糖尿病，，還有非特異性比如類風濕性關節炎，系統性紅斑狼瘡。

自身免疫性疾病是指機體對自身抗原發生免疫反應而導致自身組織損害所引起的疾病。許多疾病相繼被列為自身免疫性疾病，值得提出的是，自身抗體的存在與自身免疫性疾病并非兩個等同的概念，自身抗體可存在于無自身免疫性疾病的正常人特別是老年人，如抗甲狀腺球蛋白、甲狀腺上皮細胞、胃壁細胞、細胞核DNA抗體等。有時，受損或抗原性發生變化的組織可激發自身抗體的產生，如心肌缺血時，壞死的心肌可導致抗心肌自身抗體形成，但此抗體并無致病作用，是一種繼發性免疫反應。