慢性根尖周炎的診斷需綜合多方面因素，包括 X 線檢查、臨床癥狀、瘺管情況、局部隆起及觸診感受等。若身體出現不適癥狀，請趕快就醫，按照醫生的指導進行治療，切勿自行用藥。
1. X 線檢查：患牙根尖部牙槽骨有 X 線透射區。根尖肉芽腫為較小、規則的圓形或橢圓形透射區，邊界清晰，周圍骨質影像正常或略致密。若透射區周圍有致密骨形成的白線，且色度反差大，應懷疑為小囊腫；若開髓時有囊液從根尖孔引流出來則可證實為囊腫。慢性根尖膿腫透射區邊界不清，形狀不規則，周圍骨質影像模糊。根尖囊腫一般范圍較大，圓形，邊界清楚有白線圍繞。
2. 臨床癥狀：患者可能有牙齒咬合疼痛、咀嚼不適等癥狀。
3. 瘺管情況：慢性根尖膿腫可能發現瘺管。
4. 局部隆起：大囊腫可見相應部位有半球形隆起。
5. 觸診感受：捫診時，囊腫不痛，有乒乓球感。
綜合以上多種檢查和癥狀表現，醫生能夠較為準確地診斷慢性根尖周炎，從而為患者制定合適的治療方案。

患牙X線片上根尖區骨質破壞的影像為確診的依據。患牙牙髓活測驗結果、病史及患牙牙冠情況也可作為輔助診斷指標。診斷時統稱為“慢性根尖周炎”。

根尖周炎和根尖炎；完善的根管治療。在第一次治療時要采取有效的方法止痛，控制感染擴散。局部治療包括清洗和疏通根管，建立引流通道。已形成膿腫的切開排膿，患牙調頜等措施。還可根據患牙嚴重程度給于口服或靜脈、、滴注抗生素。