生殖器皰疹初發損害為小而柔軟的淡紅色丘疹，針帽或米粒大，逐漸增大，且數量逐漸增多，成為乳頭瘤樣、菜花樣、雞冠樣或蕈樣的贅生物，表面高低不平，質地柔軟。如不及時，表面癥狀將逐漸增大，有的成為大的菜花狀，基底有蒂;有的彼此融合，成為大塊狀，淡灰色，表面呈乳頭瘤狀，可以有糜爛、潰瘍、有分泌物，因繼發感染可致惡臭。

生殖器皰疹的病因主要是 1、男性生殖器皰疹，是由第2型單純皰疹病毒因起的性病，故又稱為性皰疹或2型兩種，1型多引起腰以上的皮膚、眼、口腔等部位的皰疹。 2、生殖器皰疹病毒2型多引起腰以下和外生殖器皮膚的皰疹，生殖器皰疹患者及帶病毒的唾液、尿、糞便中都含有病毒，通過皮膚、黏膜直接接觸病人或帶病毒者，經接吻、性交等多種方式傳播。

在早期，多數患者一般無癥狀。損害大小及形狀不等，可僅為數個，亦可為多數針頭樣大的損害。在陰肛部可長成大的腫瘤樣物，有壓迫感;有惡臭味;有時小的生殖器皰疹可出現陰部痛癢不適，病人可出現尿血和排尿困難;直腸內生殖器皰疹可發生疼痛、便血，而直腸內大的生殖器皰疹則可引起里急后重感。