根據外陰部成群水皰、局部灼熱感、有復發史、病程較短等典型特點，診斷不難。對某些不典型損害可進行實驗室診斷，常用的實驗室診斷方法有①細胞學診斷：取病損基底處細胞作涂片用瑞特姬姆薩或帕氏(Papanicolaou)染色，尋找大的多核巨細胞和多核巨細胞核內嗜酸包涵體有助于診斷。②皰疹病毒的細胞學檢查：取細胞作涂片，加熒光標記的HSV-1及HSV-2型單克隆抗體，熒光顯微鏡下查到多核巨細胞內發蘋果綠色熒光的病毒包涵體可作出診斷。③皰疹病毒組織培養：用人胚成纖維細胞、人羊膜細胞、腎細胞等作病毒分離培養，用免疫熒光法進行鑒定，可以確認，但操作復雜，費用昂貴。④電鏡檢查：有確診價值但不易普及。⑤皰疹病毒的血清學診斷：檢測HSV特異性抗體，在診斷上實用價值不大。 生殖器皰疹是誤診率較高的疾病。有很多患者僅僅有一點輕度的包皮龜頭炎，即被某些別有用心的所謂醫生們診斷為生殖器皰疹。有一些小門診部受金錢的驅使，常常誤導患者。下面介紹幾個需要鑒別診斷的疾病。 　　1.龜頭包皮炎--初起潮紅、糜爛，但很少出現水皰。可有滲液，包皮水腫不能上翻，有時有膿性分泌物。依據不同的病因可分為外傷性龜頭炎、接觸性龜頭炎、感染性龜頭炎、念珠菌性龜頭炎、阿米巴性龜頭炎、滴蟲性龜頭炎、漿細胞性龜頭炎等。 　　2.硬下疳--為硬性潰瘍，邊緣整齊。詳見梅毒。 　　3.淋病--也可發生龜頭包皮炎，但主要表現為急性化膿性尿道炎。 　　4.固定紅斑性藥疹--常常由于口服磺胺類藥物或止痛類藥物引起。發生于陰部，有紅腫，常破潰，糜爛，也有復發，要仔細地詢問病史。 4）治療　　 　　對于生殖器皰疹的治療，目前還有很多問題沒有解決，治療還不能徹底清除病毒，也不能阻止疾病的復發。治療的目的主要是緩解癥狀，減輕工業疼痛，縮短病程及防止繼發感染等。 　　目前治療分一般性治療、抗病毒治療及中醫中藥治療，這些治療都是必要的。一般性治療事實上是對癥治療，而抗病毒治療是對因治療，中醫中藥治療多通過辨證施治，標本兼治，有效地阻止復發。