后背疼痛的位置包括腰部、下背部及腰骶部。主要是因為強直性脊柱炎疾病主要侵犯中軸關節且病變發展趨勢大部分是由下而上，所以骶髂關節和腰椎受累幾乎見于所有強直性脊柱炎患者。此外，強直性脊柱炎早期一般比較隱匿，所以早期腰痛只表現為腰骶部不適或隱痛，有些患者只在勞累后發作，呈間歇性或兩側交替性酸痛，或表現為臀深部不適感。

如果強直性脊柱炎患者在初期不重視，隨著病情的進一步發展，隱痛或間歇痛會變成持續性腰骶部酸痛、刺痛和臀深部鈍痛或腰、骶、臀等部位難以言狀的酸脹不適感，夜間較重，影響睡眠，甚至在睡眠中痛醒，常常不得已下床活動以減輕疼痛。晨起或長時間保持一個姿勢，會出現腰部僵硬感，疼痛也會加重，稍事活動后又會減輕。有些患者腰部怕風怕涼，常喜多加衣被，遇風寒潮濕疼痛加重，遇溫遇熱則疼痛減輕。疼痛嚴重時病人不能下床活動，翻身困難，嚴重時還會影響患者的正常生活。

骶髂關節炎，約90%as病人最先表現為骶髂關節炎。以后上行發展至頸椎，表現為反復發作的腰痛，腰骶部僵硬感，間歇性或兩側交替出現腰痛和兩側臀部疼痛，可放射至大腿，無陽性體征，伸直抬腿試驗陰性。但直接按壓或伸展骶髂關節可引起疼痛。有些病人無骶髂關節炎癥狀，僅x線檢查發現有異常改變。約3%as頸椎最早受累，以后下行發展至腰骶部，7%as幾乎脊柱全段同時受累。