結膜炎的治療，是急性病毒性結膜炎，可點用類固醇(可地松)眼藥水，以減輕病情。細菌性結膜炎，則須投與抗生素藥水、藥膏，甚至口服或注射抗生素。治療慢性結膜炎，必須先找出原因。若是過敏原引起的，則避免接觸花粉、油漆、灰塵。若長期使用眼藥水或眼藥膏所引起的，可先停用眼藥一段時間，點用不含藥物及防腐劑之眼藥水(如生理食鹽水或人工淚液)

結膜炎的治療因病因不同而異。眼瞼可用清水和干凈毛巾輕輕洗凈，去除分泌物。如為細菌性結膜炎、可滴用抗生素眼藥水或藥膏。醫生有時會用棉簽擦下一點分泌物送實驗室檢查，再根據檢查結果調整用藥。一般結膜炎不需用皮質類固醇眼藥水。如考慮是皰疹病毒性結膜炎，則絕對不要滴用皮質類固醇眼藥水，其可能使病情加重。結膜炎多是接觸傳染，故應提倡勤洗手，避免隨意揉眼。提倡流水洗臉，毛巾、手帕等物品要與他人分開，并經常清洗消毒。對傳染性結膜炎患者應采取一定的隔離措施，更不允許到公共游泳區游泳。如果一眼患結膜炎，必須告訴病人保護健眼不受感染。凡工作環境多風、塵煙等激發者，應改善環境和戴保護眼鏡，以防引起結膜炎。

結膜炎顧名思義就是結膜的炎癥，分為細菌感染性結膜炎，病毒感染性結膜炎，過敏性結膜炎等，細菌感染性結膜炎是細菌感染結膜所引起，病毒感染性結膜炎則是病毒感染結膜所致，多見濾泡增生，過敏性結膜炎是結膜的過敏性炎癥反應，要分別根據病因有針對性的處理才能解決問題。