三歲小女孩牙齒黑壞且牙齦長肉球，可能是齲齒、牙齦炎、根尖周炎、牙齦增生、牙髓息肉等原因造成的。 1. 齲齒：食物殘渣殘留，細菌分解產生酸性物質腐蝕牙齒，形成齲洞。若齲壞嚴重，感染擴散可導致牙齦問題。 2. 牙齦炎：口腔衛生不佳，牙菌斑堆積刺激牙齦發炎，可出現紅腫。 3. 根尖周炎：齲齒未及時治療，感染蔓延至牙根尖周圍組織，形成炎癥，可能導致牙齦瘺管，表現為肉球。 4. 牙齦增生：長期服用某些藥物，如苯妥英鈉等，可能引起牙齦增生。 5. 牙髓息肉：牙髓組織增生形成息肉，從齲洞中突出，看起來像肉球。 總之，出現這種情況應及時帶孩子到正規醫院口腔科就診，明確原因后進行相應治療。同時，要培養孩子良好的口腔衛生習慣。

考慮是上火的原因，可以適當服用一些降火的藥物。

根據你說的情況我認為你說的肉球可能是牙齦感染引起的膿包，牙齒壞了以后可以引起牙齦發炎。建議你用手按一下肉球，如果有波動感是炎癥引起的化膿，可以用消毒過的針頭刺破，引流膿液，配合吃消炎藥很快就會好的。如果用手按肉球比較硬，建議你帶孩子去醫院診斷一下。