膽囊萎縮性發炎的治療選擇較為復雜，需要綜合考慮癥狀、膽囊功能、患者身體狀況等因素。手術治療能直接去除病灶，但可能有一定后遺癥；中藥治療相對溫和，但效果可能較慢。手術切除膽囊一般不會直接導致糖尿病，常見的后遺癥有消化不良、膽汁反流、膽管損傷等。 1. 癥狀：若癥狀嚴重，如頻繁劇烈腹痛、發熱、黃疸，手術可能更適合。 2. 膽囊功能：膽囊已嚴重萎縮，功能喪失，手術切除利于病情控制。 3. 身體狀況：患者身體較好，能耐受手術，手術是可行選擇。 4. 治療效果：手術能快速解決問題，中藥調理相對較慢。 5. 后遺癥風險：手術存在膽管損傷、膽汁反流等風險；中藥治療則較少有明顯后遺癥。 總之，對于膽囊萎縮性發炎，手術和中藥治療各有優缺點，應在醫生評估后，根據個體情況選擇合適的治療方案。

部分膽囊結石病人，由于膽囊炎癥的反復發作，膽囊壁逐漸產生炎癥增生、纖維化，以后慢慢形成疤痕萎縮性膽囊炎存在著癌變可能性建議還是手術治療比較好,限制草酸含量高的食物：少吃扁豆、巧克力、菠菜、無花果、核桃等食物。

膽囊炎治療方法　　急、慢性膽囊炎，目前皆以切除膽囊療效最好。　　（一）非手術療法：亦可作為術前準備，包括：a．臥床休息、禁食、腹脹者胃管減壓；b．補液，糾正水、電解質與酸堿平衡失調；c．解痙止痛；d．靜脈聯用有效抗生素對80%-85%的早期病例有效。　　　（二）手術療法　　1．急性膽囊炎：一般主張經12～24小時積極的內科治療，待癥狀緩解再擇期手術。　　2．慢性膽囊炎：無論有無結石，因膽囊已喪失功能，且為感染病灶，均應擇期手術切除。

膽囊萎縮伴有炎癥，說明膽囊已經喪失功能，建議行膽囊切除治療。可以術后配合中藥治療，要注意清淡飲食，避免油膩，高膽固醇，高脂肪飲食。戒煙戒酒。