39 個月女童細菌感染打針后夜間仍發燒，可能是以下原因：感染未完全控制、藥物起效需時間、合并其他感染、體溫調節機制不穩定、護理不當。 1. 感染未完全控制：細菌感染有時較為頑固，一次治療可能無法完全清除病菌。需繼續按醫囑用藥，完成整個療程。 2. 藥物起效需時間：藥物發揮作用有一定過程，可能還未達到有效血藥濃度，從而無法完全控制體溫。 3. 合并其他感染：可能同時存在病毒或支原體等其他病原體感染，導致病情復雜，單一治療效果不佳。 4. 體溫調節機制不穩定：幼兒體溫調節中樞發育不完善，容易出現體溫波動。 5. 護理不當：如穿著過多、室內溫度過高或過低，影響散熱和體溫調節。 總之，孩子出現這種情況，家長不必過于驚慌。密切觀察孩子的癥狀，按時復診，遵循醫生的建議進行治療和護理。

如果是細菌感染合理應用抗生素就會恢復正常的.孩子的體溫一般要在三四天的時間消退，只要體溫不斷的降低就沒有事的，目前要以消炎治療為主，多喝水。