結膜炎的危害包括眼部不適、影響視力、引發全身癥狀、形成潰瘍及導致皰狀潰瘍等。藥物治療需謹慎，身體出現不適時，應首先尋求醫生的意見，避免盲目用藥。
1.眼部不適：眼睛灼熱、畏光、紅腫、疼痛，晨起眼瞼有分泌物。
2.視力影響：嚴重時可能影響視力。
3.全身癥狀：如頭痛、發燒、疲勞、耳廓淋巴結腫大。
4.形成潰瘍：可能深至鞏膜表面，愈合后留疤。
5.皰狀潰瘍：常見于維生素A缺乏癥。
結膜炎危害不容小覷，一旦出現相關癥狀，應及時就醫診治。

結膜炎發作時會影響正常的工作和生活,如果不注意,還會傳染給他人.若急性結膜炎轉為慢性,則常年遷延不愈,有異物感,眼疲勞不適,長期如此,嚴重影響正常生活.嚴重的結膜炎還可引起上瞼下垂,瞼球粘連等.

一般可用抗生素軟膏或點眼藥治療細菌性感染,癥狀通常會在用藥后的1周內消失.嚴重的細菌性感染,得用口服抗生素藥劑或抗生素針劑治療,通常得費時6周才會完全復原.