患者生殖器部位有燒灼感，出現(xiàn)紅斑，隨后在紅斑基礎(chǔ)上出現(xiàn)成簇分布的小水皰，幾天后可以發(fā)展為膿皰，逐漸破潰，糜爛潰瘍，患者自覺劇烈疼痛。男性發(fā)病多位于龜頭、冠狀溝等處，有時(shí)可并發(fā)尿道炎。多數(shù)患者有并發(fā)癥狀如雙側(cè)腹股溝淋巴結(jié)腫大。

在早期，若是癥狀表現(xiàn)不明顯的生殖器皰疹，會出現(xiàn)外陰瘙癢，灼痛或性交后疼痛等不適癥狀。多發(fā)性鱗狀上皮增生，一開始是散在或者是簇狀增生粉色、白色小乳頭狀的疣，柔軟，有細(xì)指樣突起。增大之后呈雞冠狀、菜花狀、桑葚狀。

女性生殖器皰疹的癥狀表現(xiàn)為從外陰至陰道、宮頸等處都長滿了一片毛棘或很多小菜花狀突起，好似玫瑰色的芒刺或雞冠花。生殖器皰疹的數(shù)目少則數(shù)個(gè)，多則十余個(gè)，數(shù)十個(gè)以至百個(gè)之多。極少數(shù)病人由于不及時(shí)，使生殖器皰疹長得很大，成為巨大生殖器皰疹，可向深部穿透，產(chǎn)生很多瘺管通向尿道或經(jīng)5-40年惡變?yōu)榘┠[，這些都是生殖器皰疹的癥狀。