首先要確診是否是生殖器皰疹，可以用醋酸檢查。生殖器皰疹潛伏期從三周到八個月不等，初期是紅色小疙瘩，逐漸長成菜花狀、雞冠狀、乳頭狀等，表面濕潤，凹凸不平。 生殖器皰疹初發損害為小而柔軟的淡紅色丘疹，針帽或米粒大，逐漸增大，且數量逐漸增多，成為乳頭瘤樣、菜花樣、雞冠樣或蕈樣的贅生物，表面高低不平，質地柔軟。如不及時，表面癥狀將逐漸增大，有的成為大的菜花狀，基底有蒂;有的彼此融合，成為大塊狀，淡灰色，表面呈乳頭瘤狀，可以有糜爛、潰瘍、有分泌物，因繼發感染可致惡臭。

生殖器皰疹開始為細小的淡紅色丘疹，以后逐漸增大，數目增多，表面隆起，多數質地脆而硬，高低不平的疣狀增生，臨床上依其形態分為蕈狀、雞冠狀、菜花狀、乳頭狀。生殖器皰疹體表面顯紅色或污灰色或正常皮色，局部濕潤，部分病人感到瘙癢，性交時疼痛或出血，由于自覺或不自覺的搔抓，可使表面癥狀破損，形成糜爛，出現滲液而繼發感染。

原發性生殖器皰疹有潛伏期，患者有頭疼、發燒等全身癥狀，如果有不當性交，出現下述癥狀，很可能是感染了疾病。