在早期，多數患者一般無癥狀。損害大小及形狀不等，可僅為數個，亦可為多數針頭樣大的損害。在陰肛部可長成大的腫瘤樣物，有壓迫感;有惡臭味;有時小的生殖器皰疹可出現陰部痛癢不適，病人可出現尿血和排尿困難;直腸內生殖器皰疹可發生疼痛、便血，而直腸內大的生殖器皰疹則可引起里急后重感。 治療生殖器皰疹，需要患者改掉以前的飲食習慣，注意一些辛辣的食物盡量少吃，在生活中，如果患者比較喜歡吃辛辣刺激性食物，一定要改變自己的飲食習慣。生姜、辣椒、羊肉、牛肉及煎炸食物等辛辣溫熱之品，食后易助火生熱，中醫認為，本病為濕熱火毒蘊結肌膚所生，故皰疹患者應忌食上述辛辣食品。

男性生殖器皰疹在龜頭、冠狀溝、尿道口、陰莖、陰囊等處。生殖器皰疹臨床表現中可分為原發和復發兩種，原發指首次感染病毒，一般從接觸到發病約2～10天，也就是潛伏期，患病部位現有燒灼感，很快在紅斑基礎上發生3～10個成群的紅色丘疹，伴有瘙癢，丘疹很快變成小水皰，3～5天后變為膿包，破潰后形成大片的糜爛和潰瘍，自覺疼痛，最后結痂愈合。患者飲食最好以清淡為主，高纖食品最好多吃一些，用檸檬泡水喝會比較好，對于檸檬汁用來擦長疹子的地方也會有效果。禁止吃發類的物質：如牛肉、羊肉 、狗肉等。皰疹患者對油膩的食物也最好不要吃，辛辣溫熱食物也不要吃太多。這些食物易引起皰疹病毒感染，加重患處的病情，導致皰疹的發生。

皮損初起為單個或多個散在的淡紅色小丘疹，質地柔軟，頂端尖銳，后漸增多增大，依表面癥狀形態可分為無柄型（即丘疹樣皮損）和有柄型，后者可呈乳頭狀、菜花狀、雞冠狀及蕈樣狀；表面癥狀常呈白色、粉紅色或污灰色，表面易發生糜爛，有滲液、浸漬及破潰，尚可合并出血及感染；多數患者無明顯自覺癥狀，少數可有異物感、灼痛、刺癢或性交不適。在皰疹活動期，應少食辛辣油膩食品，因為生殖器皰疹活動期的皮損表現屬于中醫學中的熱證，而辛辣之品有助熱發散的作用，可以加重局部癥狀；在病毒靜止期，可以多進食一些富含蛋白質和維生素的食品，并且鍛煉身體，以增強體質，增強免疫力，減少復發。在生殖器皰疹急性期還要適當休息。