小便后下體不適且雙膝蓋酸痛，可能由以下因素導致：泌尿系統感染、腎臟疾病、關節炎、腰椎間盤突出、體內電解質紊亂等。一旦身體出現不適，應立刻就醫，遵從醫生的指示進行治療，不宜自行開藥。
1.泌尿系統感染：細菌侵入泌尿系統引起炎癥，常見癥狀包括尿頻、尿急、尿痛等。治療通常使用抗生素，如左氧氟沙星、頭孢呋辛酯、阿莫西林等，需遵醫囑用藥。
2.腎臟疾病：如腎炎、腎結石等，可能影響尿液生成和排泄。需要進行尿常規、腎功能等檢查，明確診斷。治療方法因病而異，可能包括藥物治療、手術治療等。
3.關節炎：如風濕性關節炎、骨性關節炎等，可導致膝蓋酸痛。常用藥物有布洛芬、雙氯芬酸鈉、塞來昔布等，同時要注意休息和保暖。
4.腰椎間盤突出：壓迫神經可能引起下肢放射性疼痛。治療包括物理治療、藥物治療（如甲鈷胺、維生素 B12 等）和手術治療。
5.體內電解質紊亂：鉀、鈉、鈣等失衡，也可能出現上述癥狀。需要通過血液檢查明確，補充相應電解質。
總之，出現小便后下體不適且雙膝蓋酸痛的癥狀，原因較為復雜。建議及時到正規醫院就診，進行相關檢查，明確病因后在醫生的指導下進行治療。