替諾福韋有可能會產生耐藥性，這與患者個體差異、用藥依從性、病毒變異、合并用藥以及治療時長等多種因素相關。 1. 個體差異：不同患者的身體狀況和基因特點會影響對藥物的反應，部分患者可能更容易出現耐藥。 2. 用藥依從性：未按時按量服用替諾福韋，導致血藥濃度不穩定，增加耐藥風險。 3. 病毒變異：乙肝病毒等可能發生變異，使其對替諾福韋不再敏感。 4. 合并用藥：同時使用某些可能相互影響的藥物，干擾替諾福韋的作用，間接導致耐藥。 5. 治療時長：長期使用替諾福韋，病毒可能逐漸適應藥物，產生耐藥性。 總之，雖然替諾福韋有耐藥的可能性，但在醫生的指導下規范用藥、定期復查，能有效降低耐藥發生的概率。患者切勿自行增減藥量或停藥。

耐藥變異是所有核苷類藥的共性，替諾福韋當然不會例外。然而，不同核苷類藥發生耐藥變異的“門檻”有高低、相差很大。恩替卡韋和替諾福韋的耐藥門檻都很高，恩替卡韋5年的耐藥率1.2%；替諾福韋從08年做臨床試驗到現在已經3年多，還沒有發現耐藥。現在知道它的耐藥位點A194T，是從2名艾滋病合并乙型肝炎的患者發生的。只有在阿德福韋耐藥換用替諾福韋的患者中，查出過A181T和N236V，但那是阿德福韋的耐藥位點。