慢性乙型肝炎自然過程中，E抗原的變化較為復雜，受到多種因素影響，如病毒自身特點、患者免疫狀態、病程階段、治療干預以及合并其他疾病等。 1. 病毒自身特點：不同基因型的乙肝病毒，其 E 抗原的表達和變化可能存在差異。 2. 患者免疫狀態：免疫功能較強時，可能促使 E 抗原轉陰；免疫功能較弱時，E 抗原可能持續陽性。 3. 病程階段：在感染初期，E 抗原常為陽性；隨著病情進展，可能會發生血清學轉換，E 抗原轉陰。 4. 治療干預：未經治療時，E 抗原變化相對緩慢；接受抗病毒治療后，可能加快其轉陰的進程。 5. 合并其他疾病：若同時患有其他影響免疫的疾病，如自身免疫性疾病，可能影響 E 抗原的變化。 總之，慢性乙型肝炎患者 E 抗原的變化是一個動態且受多種因素影響的過程，需要定期監測和綜合評估。

E抗原（HBeAg）是“乙肝兩對半”第三項。E抗原是乙肝病毒內膜的可溶性成分，與HBV DNA密切相關，與血清HBV DNA水平非常一致，E抗原陽性表示乙肝病毒正在活躍復制。　　在 “大三陽”慢性攜帶的人，E抗原表示個人的免疫耐受性，病毒和E抗原水平都很高，卻能防止病毒對肝細胞的侵襲。　　在年輕人，“大三陽”的肝炎開始發病，病毒水平很高，肝細胞病變卻可能較輕。在中年人，早已感染病毒或肝炎發病，如果還是“大三陽”，病毒水平一般不太高，也未必完全是“大三陽”的病毒。大多病變持久活動，隨年齡增高而有病變進展的高危性。最后到中老年的肝炎，幾乎都轉為“小三陽”，發生活動性肝硬化和肝癌的風險更高。