一般情況下，在得了生殖器皰疹之后，癥狀多在4-5日后發病，患者的生殖器在初期一般就會出現片狀的紅斑，隨著病情的發生繼之出現群集性綠豆大小、發亮水泡，排列成帶狀，水皰間皮膚正常，皰液由透明變混濁，以后干燥結痂，受累神經分布區域皮膚灼熱、瘙癢、感覺過敏或疼痛，有時為劇烈疼痛，直至病損消失后還可持續數月或更久。生殖器皰疹患者要避免性亂，潔身自好，這樣能減少絕大部分的感染機會。洗浴后不直接坐在公共浴池的坐椅上;在公共廁所盡量使用蹲式馬桶。講究衛生，每日清洗外陰，換洗內褲。在平常生活中做到營養均衡膳食搭配，應該吃一些高蛋白富有營養的食物，還需要吃一些水果和蔬菜補充人體的維生素和礦物質。

生殖器皰疹的潛伏周期一般是三天到半個月左右。這些皰疹會生長在生殖器和肛門附近，類似于小水皰，四天以內形成潰瘍，患者會感覺到疼痛。同時，腹股溝的淋巴結會腫大，按壓起來也有些疼。患者會出現發燒和無力以及頭痛等全身癥狀，病程一般都是半個月以內。患者飲食最好以清淡為主，高纖食品最好多吃一些，用檸檬泡水喝會比較好，對于檸檬汁用來擦長疹子的地方也會有效果。禁止吃發類的物質：如牛肉、羊肉 、狗肉等。皰疹患者對油膩的食物也最好不要吃，辛辣溫熱食物也不要吃太多。這些食物易引起皰疹病毒感染，加重患處的病情，導致皰疹的發生。

生殖器皰疹的發病，一方面是感染了單純皰疹二型病毒，另一方面是機體或局部免疫力下降。因此治療也要從這兩個方面入手，即抗病毒、提高免疫力。但是皰疹病毒潛伏在體內是不容易去除的，這也是生殖器皰疹易復發的一個原因。生殖器皰疹危害很大，還能傳染給嬰兒，影響生育質量。陰道患有生殖器皰疹的孕婦，在分娩時，通過產道的嬰兒可能被傳染，引起嬰幼兒的咬吸道疣。