生殖器皰疹開始局部先有灼癢及輕度緊張感，偶有伴發神經痛。隨即出現紅斑，在紅斑基礎上發生簇集性小丘疹，迅速變為粟粒至綠豆大小的水皰，內容澄清，水皰破裂后出現糜爛面，數日后干燥結痂。自覺灼癢，偶有倦怠，不適和輕微發熱等全身癥狀，愈合可遺留暫時性色素沉著。生殖器皰疹患者飲食最好以清淡為主，高纖食品最好多吃一些，用檸檬泡水喝會比較好，對于檸檬汁用來擦長疹子的地方也會有效果。禁止吃發類的物質：如牛肉、羊肉 、狗肉等。皰疹患者對油膩的食物也最好不要吃，辛辣溫熱食物也不要吃太多。這些食物易引起皰疹病毒感染，加重患處的病情，導致皰疹的發生。

皰疹大部分都生在患者男性生殖器的龜頭、冠狀溝、、陰莖體、尿道口和陰囊等部位。患病初期會出現火熱，疼痛，而且病情會蔓延到臀部、股部位置。患者的外陰還會長出丘疹、水孢。而且水孢比較容易破損，破損后會出現潰爛或者淺潰爛。經過4-5天后，破損的水孢會結疤，但是在10天之后破損的地方就會康復。生活中注意個人衛生，禁食辛辣刺激性食物等，加強營養，提高機體免疫力。發現疾病應該去正規的公立專科性病醫院，公立醫院在收費和專家資質上還是相對有保障的。

在早期，多數患者一般無癥狀。損害大小及形狀不等，可僅為數個，亦可為多數針頭樣大的損害。在陰肛部可長成大的腫瘤樣物，有壓迫感;有惡臭味;有時小的生殖器皰疹可出現陰部痛癢不適，病人可出現尿血和排尿困難;直腸內生殖器皰疹可發生疼痛、便血，而直腸內大的生殖器皰疹則可引起里急后重感。生殖器皰疹的傳染性是很強的，所以發現之后要禁止性生活，并且積極治療，如果不及時的話對男性以及治療伴侶的健康會帶來極大的危害。