生殖器皰疹病毒經皮膚破損進入體內后，可經血液或神經通絡擴散。其潛伏期為3-5天。初發病時病變部位有燒灼感。很快發生丘斑，成群丘疹，繼而成為水皰，開始水皰透明，逐漸化膿，破潰，糜爛并形成潰瘍。患者多有劇痛和繼發感染。對于生殖器皰疹的患者，必要的忌口是防止復發的必要條件。如常吃辛辣發物，抽煙飲酒都對康復不利，特別是飲酒可促使本病復發，加重本病的癥狀，所以，患病后一定不要飲酒。多吃富含維生素、蛋白質的食物有助于疾病的康復，如新鮮的蔬菜、水果及牛奶、雞蛋等。

一般情況下，在得了生殖器皰疹之后，癥狀多在4-5日后發病，患者的生殖器在初期一般就會出現片狀的紅斑，隨著病情的發生繼之出現群集性綠豆大小、發亮水泡，排列成帶狀，水皰間皮膚正常，皰液由透明變混濁，以后干燥結痂，受累神經分布區域皮膚灼熱、瘙癢、感覺過敏或疼痛，有時為劇烈疼痛，直至病損消失后還可持續數月或更久。生殖器皰疹患者要避免性亂，潔身自好，這樣能減少絕大部分的感染機會。洗浴后不直接坐在公共浴池的坐椅上;在公共廁所盡量使用蹲式馬桶。講究衛生，每日清洗外陰，換洗內褲。在平常生活中做到營養均衡膳食搭配，應該吃一些高蛋白富有營養的食物，還需要吃一些水果和蔬菜補充人體的維生素和礦物質。

生殖器皰疹的潛伏周期一般是三天到半個月左右。這些皰疹會生長在生殖器和肛門附近，類似于小水皰，四天以內形成潰瘍，患者會感覺到疼痛。同時，腹股溝的淋巴結會腫大，按壓起來也有些疼。患者會出現發燒和無力以及頭痛等全身癥狀，病程一般都是半個月以內。