目前醫學上對膽道結石的真正成因還不是很清楚，但有幾個因素卻是明確影響結石生成的。 首先是膽道的狹窄。比如說膽管的某一段狹窄或者痙攣，導致膽汁流動不暢，膽汁內的固體成分就會沉積而形成結石。這跟河道狹窄或者大拐彎影響河水流動而形成河道淤泥一個道理； 其次是膽道的感染。膽汁里是有細菌的，如果細菌增生（比如腸道的細菌反流至膽道）就會導致膽道的炎癥，導致膽汁內雜質增生，膽道功能減退，容易形成結石。 這是兩個最主要的原因，它們之間又相互影響。膽道梗阻會導致膽汁流動不暢，流水不腐，水不流或流動慢就容易滋生細菌；細菌導致膽道炎癥水腫加重，加重膽道梗阻；最后就是一個惡性循環，石頭形成而且越滾越大。

膽道結石是膽道系統中最常見的疾病，包括膽囊結石、膽總管結石和肝內膽管結石。一般與膽道感染（尤其是寄生蟲的感染）有關。膽汁的淤積及膽固醇代謝失調為結石的主要原因，且往往是多種原因綜合形成結石。

肝內膽管結石是怎么形成的?隨著我們的生活水平提高，也因為不注意調理保養，導致膽結石發病率也越來越高，而肝內膽總管結石就是其中常見的一種，且以膽固醇結石為主。而需要注意的就是肝內膽管結石的發生，主要與不良的生活、飲食等習慣都是有很大關系。