在卵巢部位出現巧克力囊腫，這屬于子宮內膜異位癥的一種情況，因為有子宮內膜異位癥容易導致盆腔粘連影響輸卵管的通暢度和輸卵管的輸送受精卵的情況，影響排卵機制不是很清楚，針對于這個病的治療，如果打算要孩子先做腹腔鏡，把囊腫切除把盆腔內異味的病灶清掃干凈，疏通一下輸卵管的粘連情況，可以吃口服避孕藥或者是高效孕激素規范的調理三個月，然后促排卵來懷孕

卵巢巧克力囊腫實際上是子宮內膜異位癥的病變。可以采用藥物治療效果，如果效果不顯著或卵巢有較大的包塊,采用保守性手術是不錯的選擇,如卵巢內膜囊腫巧克力液抽吸術,內膜囊腫剝除術或患側卵巢切除術,來保留正常卵巢和生育功能。

卵巢囊腫是婦科常見病癥，一般采用觀察療法或手術治療。手術治療創傷大，但如切除一側卵巢，則可能影響女性內分泌狀態，易發生月經紊亂、不孕和卵巢早衰等癥。西京醫院婦產科在介入治療前首先向患者及家屬介紹超聲波介入治療卵巢囊腫的方法和優、缺點，征得患者同意和配合。 介入治療一般在月經干凈后進行。在陰道B超監視下穿刺卵巢囊腫，抽吸囊內液，并向囊腔內注入無水乙醇，同時對囊內液進行檢驗。該科從1999年以來，已用此法治療160名病人，均穿刺成功，平均介入治療時間為13分鐘。148名患者囊內液完全吸凈，另12名有部分殘留，但體積小于原體積的1/2。隨訪1年，復發率為13.9％，以巧克力囊腫復發為多，復發均在治療后6個月內。囊內液檢查均未見瘤細胞。 據專家介紹，超聲介入治療單純卵巢囊腫，方法簡單安全，療效確切，無明顯副作用，復發率低，尤其適用于年輕未育婦女。但該法不大適合卵巢巧克力囊腫。

卵巢子宮內膜異位囊腫又名卵巢巧克力囊腫，也是較為常見的卵巢囊腫，是由于子宮內膜異位癥波及卵巢在卵巢內形成含有巧克力樣粘稠液體的囊腫。腫塊的大小不一，大的直徑可在10厘米以上。患者常有進行性加重的痛經、性交痛、不孕以及月經失調。婦科檢查時盆腔有觸痛性結節。卵巢巧克力囊腫的治療要根據患者的年齡、囊腫大小、痛經程度、有無生育要求等綜合考慮，分別采取藥物、保守性手術直至根治性手術治療。