松果體位于第三腦室頂，故又稱為腦上腺（epiphysis），其一端借細柄與第三腦室頂相連，第三腦室凸向柄內形成松果體隱窩。松果體表面被以由軟腦膜延續而來的結締組織被膜，被膜隨血管伸入實質內，將實質分為許多不規則小葉，小葉主要由松果體細胞（pinealocyte）、神經膠質細胞和神經纖維等組成。松果體細胞是松果體內的主要細胞。在HE染色標本中，細胞為圓形或不規則形。核大，圓形、不規則形或分葉狀，著色淺，核仁明顯。胞質呈弱嗜堿性，含有少量脂滴。在鍍銀染色標本中，松果體細胞形狀不規則，有長短不一的突起，突起末端膨大，常止于血管周圍。電鏡下，細胞質內有粗面內質網，高爾基復合體和小圓形分泌顆粒，顆粒內含有褪黑激素（melatonin）。胞質內還有較豐富的線粒體、游離核糖體和脂滴。細胞膜常與神經末梢形成突觸；在松果體細胞近突觸部可見有突觸帶（synapticribbon），突觸帶由中等電子密度高的小棒狀結構及其周圍的小泡組成，其功能不清。神經膠質細胞較少，位于松果體細胞之間。在HE染色標本中，細胞胞體小，形態不規則，細胞核小，染色深。細胞有突起，末端附著在松果體細胞或伸到血管周圍間隙。電鏡下可見胞質內含有豐富的粗面內質網、游離核糖體和微絲等。在松果體細胞之間還可見到一些圓形、卵圓形或不規則形鈣化顆粒，稱為腦沙（brainsand）。其成分主要為磷酸鈣和碳酸鈣。腦沙一般出現在青春期后，其量隨年齡而增加。腦沙的功能意義尚不清楚，有人認為。腦沙的數量可能反映其過去分泌激素的活動情況。松果體的神經主要來自預交感神經節節后纖維，神經末梢主要止于血管周圍間隙，少量止于松果體細胞之間，有的與細胞形成突觸。松果體的功能尚不十分了解。一般認為，人的松果體能合成、分泌多種生物膠和肽類物質，主要是調節神經的分泌和生殖系統的功能，而這種調節具有很強的生物節律性，并與光線的強度有關。松果體細胞交替性地分泌褪黑激素和5-羥色胺，有明顯的晝夜節律，白晝分泌5-羥色胺，黑夜分泌褪黑激素，褪黑激素可能抑制促性腺激素及其釋放激素的合成與分泌，對生殖起抑制作用

松果體區腫瘤患者的預后因其組織學類型、病情的嚴重程度及治療情況不同而異，生殖細胞瘤患者預后較好(有報道5年存活率為83%)，而松果體母細胞瘤和混合性胚細胞瘤患者的預后較差。Jouvet等根據松果體實質瘤的組織學特征將其預后分為4級：松果體細胞瘤為Ⅰ級；光學顯微鏡下發生有絲分裂的細胞少于6個且神經絲免疫標記為陽性的松果體實質瘤為Ⅱ級；光鏡下發生有絲分裂的細胞大于或等于6個，或神經絲免疫標記為陰性的松果體瘤為Ⅲ級；松果體母細胞瘤預后最差，為Ⅳ級。

松果體位于第三腦室頂，故又稱為腦上腺（epiphysis），其一端借細柄與第三腦室頂相連，第三腦室凸向柄內形成松果體隱窩。松果體表面被以由軟腦膜延續而來的結締組織被膜，被膜隨血管伸入實質內，將實質分為許多不規則小葉，小葉主要由松果體細胞（pinealocyte）、神經膠質細胞和神經纖維等組成。松果體細胞是松果體內的主要細胞。在HE染色標本中，細胞為圓形或不規則形。核大，圓形、不規則形或分葉狀，著色淺，核仁明顯。胞質呈弱嗜堿性，含有少量脂滴。在鍍銀染色標本中，松果體細胞形狀不規則，有長短不一的突起，突起末端膨大，常止于血管周圍。電鏡下，細胞質內有粗面內質網，高爾基復合體和小圓形分泌顆粒，顆粒內含有褪黑激素（melatonin）。胞質內還有較豐富的線粒體、游離核糖體和脂滴。細胞膜常與神經末梢形成突觸；在松果體細胞近突觸部可見有突觸帶（synapticribbon），突觸帶由中等電子密度高的小棒狀結構及其周圍的小泡組成，其功能不清。神經膠質細胞較少，位于松果體細胞之間。在HE染色標本中，細胞胞體小，形態不規則，細胞核小，染色深。細胞有突起，末端附著在松果體細胞或伸到血管周圍間隙。電鏡下可見胞質內含有豐富的粗面內質網、游離核糖體和微絲等。在松果體細胞之間還可見到一些圓形、卵圓形或不規則形鈣化顆粒，稱為腦沙（brainsand）。其成分主要為磷酸鈣和碳酸鈣。腦沙一般出現在青春期后，其量隨年齡而增加。腦沙的功能意義尚不清楚，有人認為。腦沙的數量可能反映其過去分泌激素的活動情況。松果體的神經主要來自預交感神經節節后纖維，神經末梢主要止于血管周圍間隙，少量止于松果體細胞之間，有的與細胞形成突觸。松果體的功能尚不十分了解。一般認為，人的松果體能合成、分泌多種生物膠和肽類物質，主要是調節神經的分泌和生殖系統的功能，而這種調節具有很強的生物節律性，并與光線的強度有關。松果體細胞交替性地分泌褪黑激素和5-羥色胺，有明顯的晝夜節律，白晝分泌5-羥色胺，黑夜分泌褪黑激素，褪黑激素可能抑制促性腺激素及其釋放激素的合成與分泌，對生殖起抑制作用。

松果體在中腦前丘和丘腦之間。為一豆狀小體，長5～8mm，寬為3～5mm的橢圓形小體，松果體是人體一個重要的中樞神經，功能復雜，尚有很多功能不為人所知。松果體區腫瘤MRI顯示圖圖冊松果體的畸胎瘤的絨毛組織和生殖細胞瘤都可以分泌HCG，分泌的激素足夠引起性早熟。這樣的腫瘤具有絨毛膜癌的組織學和功能特征。松果體瘤導致性早熟可能由于腫瘤壓迫或破壞影響下丘腦的調節功能或HCG的分泌。神經內分泌解剖結果認為，由于腦的其他腫瘤擴大延伸到松果體引起性早熟。引起性早熟的另一可能原因是由于松果體產生一種抑制垂體分泌促性腺激素的物質，如松果體被破壞，抑制作用消失，產生性早熟。也可能腫瘤超越松果體區域，引起第三腦室積水或損害下丘腦，從而引起性早熟。