陰莖流黃水且小便疼痛，可能是尿道炎、前列腺炎、淋病、龜頭炎、尿路結石等原因引起的。 1.尿道炎：多由細菌感染引起，常見致病菌有大腸桿菌等。會出現尿頻、尿急、尿痛，尿道口紅腫、有分泌物。治療常使用左氧氟沙星、頭孢曲松鈉、阿奇霉素等藥物。 2.前列腺炎：可由病原體感染、排尿功能障礙等導致。除上述癥狀外，還可能有會陰部疼痛等。治療藥物有環丙沙星、多沙唑嗪、塞來昔布等。 3.淋病：是性傳播疾病，由淋病奈瑟菌感染所致。尿道口大量膿性分泌物，伴有尿痛。治療藥物包括頭孢噻肟、大觀霉素、頭孢曲松等。 4.龜頭炎：與局部刺激、感染等有關。龜頭紅腫、疼痛，可有分泌物。可外用克霉唑乳膏、莫匹羅星軟膏等。 5.尿路結石：結石刺激尿路黏膜，引發炎癥，導致疼痛和分泌物。較小結石可通過多飲水排出，較大結石可能需體外沖擊波碎石或手術治療。 出現陰莖流黃水且小便疼痛的癥狀，應及時到正規醫院泌尿外科就診，明確病因，遵醫囑進行治療。同時要注意個人衛生，避免不潔性行為。

有可能是，龜頭炎尿路感染等引起的，建議您去正規的醫院檢查，確診后在醫生的指導下用消炎藥治療，治療期間需要禁止性生活