嬰兒先天性甲狀腺功能低下在孕檢時未查出，可能有多種原因，如胎兒期甲狀腺發育特點、檢測技術局限、母體激素影響、檢測時機以及疾病的復雜性等。 1.胎兒期甲狀腺發育特點：胎兒甲狀腺在妊娠早期開始發育，但功能尚不完善，激素水平不穩定，可能導致檢測不準確。 2.檢測技術局限：目前的孕檢技術雖然不斷進步，但對于某些細微的甲狀腺功能異常可能難以完全檢測到。 3.母體激素影響：母體自身的激素水平可能會干擾對胎兒甲狀腺功能的判斷。 4.檢測時機：如果檢測時間過早或過晚，可能錯過發現異常的最佳時機。 5.疾病的復雜性：先天性甲狀腺功能低下的發病機制較為復雜，有時難以通過常規孕檢手段及時發現。 總之，雖然孕檢在保障胎兒健康方面發揮了重要作用，但仍存在一定的局限性。對于出生后發現的先天性甲狀腺功能低下，應及時干預治療，以減少對嬰兒生長發育的不良影響。

您好，嬰兒患有甲狀腺疾病一般是通過遺傳導致的，但是在孕檢時是很難發現胎兒被遺傳的。建議及時治療，不能對孩子的正常發育是有影響的。