手術療法：適用于非手術治療失敗或成人完全性直腸脫垂。常用的手術有經腹的如Goldberg手術（即直腸縫合固定加乙狀結腸部分切除吻合術）、Orr手術（直腸骶骨懸吊術）、Ivalon海綿植入術、Nigro手術（適用于盆地缺損較大，直腸角完全消失的完全性直腸脫垂）和直腸前壁折疊術。經會陰的如Altemeir手術（適用于年老體弱，不能耐受經腹手術的患者）和肛門環縮術（適用于年老、體弱不能耐受交大手術者，或作為輔助治療。）近年來隨著腹腔鏡手術技術的發展，也開展了經腹腔鏡手術治療直腸脫垂，適用于直腸脫垂行懸吊術者。

一般治療：去除病因，如治療便秘，慢性咳嗽及前列腺肥大等，每日行提　肛鍛煉數百次，增強括約肌功能，防止脫垂。并養成良好的大便習慣，縮短排便時間，脫垂后立即復位，防止水腫，嵌頓。硬化劑注射療法：適用于病程較長的兒童及用膠布粘合法無效者，以及成人輕度直腸脫垂。用骶管麻醉或局麻，兒童可用全麻。常用的有骨盆直腸間隙注射法和黏膜注射法。前者目的是使直腸和周圍組織黏連固定，后者是使黏膜與直腸肌層黏連固定。