肛瘺的治療原則是手術為主，因為只有進行手術，才能找到原發的內口，并把感染的肛竇、肛門腺及其導管切除干凈，這是肛瘺治療的關鍵。清除內口：手術時要找到原發的內口，并把感染的肛竇、肛門腺及其導管切除干凈，這是肛瘺治療的關鍵。處理好瘺管及支管、死腔：要把瘺管的管道、支管、死腔等清除干凈，以免術后復發。保留肛管直腸環：肛瘺手術時，應明確診斷，查明內口及瘺管走向，保留肛管直腸環，以維持正常的肛門括約功能。及時去醫院接受治療，以免錯過最佳治療時間

肛瘺是肛腸科的常見疾病的，一旦確診為肛瘺，唯一有效的方法就是手術的，除此之外沒還有保守療法的，但是保守治療一般只能減輕癥狀和減少發作?；颊呖梢赃x擇微創無痛手術的，痛苦小，一般不用住院的。調理排便：保持大便通暢，防止腹瀉或便秘，以減少糞便對肛瘺內口的刺激。清潔肛門要勤換內褲。

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