腎囊腫是否影響腎功能，主要取決于囊腫數量、大小等。常見的影響因素有囊腫大小、數量、位置、生長速度、是否有并發癥等。身體感到不適時，務必及時就診，聽從醫生的建議進行診治，不要自己擅自用藥。
1.囊腫大小：直徑大于3cm時可能影響腎功能。
2.囊腫數量：數目眾多時增加影響腎功能的風險。
3.囊腫位置：靠近腎盂等關鍵部位可能影響更大。
4.生長速度：快速生長的囊腫更易影響腎功能。
5.并發癥：若合并感染、出血等，易損害腎功能。
多數腎囊腫無癥狀且不影響腎功能，一旦出現影響腎功能的情況，應及時就醫治療。

腎囊腫一旦病情復發會給腎臟功能帶來損失，一旦沒有及時的治療最終會導致腎衰竭，建議患者應該在病情較輕的時候得到有效的治療。

腎囊腫只要沒有五厘米建議采用中醫的治療方法進行治療，超過吳利民建議采用手術治療方法，在手術治療的同時建議患者注意飲食的問題。

患有腎囊腫的患者不要抱有僥幸的心理，以為現在沒有什么癥狀就以為沒事，等到有一天腎囊腫危及到腎臟就不是那么簡單的事了，有可能會導致生命危險。