小拇指短于無名指第二關節與生育能力通常沒有直接關系。生育能力主要取決于生殖系統的健康狀況，包括卵巢功能、子宮狀況、精子質量等。小拇指的形態一般不反映生育能力，影響生育的因素有遺傳因素、內分泌失調、生殖系統疾病、生活習慣、環境因素等。 1.遺傳因素：某些遺傳疾病可能影響生殖系統發育和功能，但單純小拇指形態不是遺傳疾病的特征表現。 2.內分泌失調：如激素水平失衡，可能導致排卵異常或精子生成障礙。 3.生殖系統疾病：女性的多囊卵巢綜合征、輸卵管堵塞，男性的精索靜脈曲張等會影響生育。 4.生活習慣：長期熬夜、吸煙、酗酒、過度勞累等不良生活方式可能降低生育能力。 5.環境因素：長期暴露在有害化學物質、輻射環境中，也可能對生殖系統造成損害。 總之，小拇指的形態不是判斷生育能力的依據。如果擔心生育問題，應到正規醫院進行全面的生殖系統檢查，以便明確自身的生育狀況。

你好朋友根據你的描述情況分析；是否是遺傳，最好醫院拍片檢查，