引起性交疼痛的原因很多,生殖器官和泌尿系統的各種疾病,先天畸形等都可能引起.較典型的病變是接近陰道后穹窿的宮底韌帶上有內膜異位結節,盆腔內炎癥使腹膜臟器粘連,陰莖插入時撞擊宮頸,引起腹膜振動而牽動臟器產生疼痛.陰道潤滑不足時可以發生疼痛,女性盆腔臟器炎癥粘連,局部疤痕,宮頸炎,子宮內膜炎,卵巢的囊腫或腫瘤,陰道痙攣等都會產生性交疼痛.在沒有器質性病變的情況下,性交疼痛主要是陰道潤滑不足造成的,主要有兩方面原因：一是性交前的準備不充分,即調情動作不夠;二是有焦慮,緊張情緒,思想不集中,以及工作,生活所帶來的抑郁不快等。

一是外來壓力刺激。從解剖角度而言，女性的尿道、膀胱底部與陰道相鄰，子宮及其附件與陰道的關系十分密切。做愛時，由于受外界的壓力刺激和性欲亢進時的充血，生殖器官以及盆腔組織器官會出現不同程度的收縮、痙攣，從而發生腹痛。二是做愛急躁粗暴。在房事過程中，男子動作過于急躁、粗暴或擠壓，導致女性腹部疼痛。三是前列腺素影響。在男性的精液中含有一種叫前列腺素的物質，這種物質可刺激女性子宮收縮，尤其是妊娠后的女性，這種特殊的生理現象可能會引起少數女性做愛時腹痛。此外，婦科炎癥也會因做愛時受刺激而感覺疼痛。這就需要通過就醫治療來解除。