自身免疫學說與白癜風的發病關系日益受到重視，許多學者注意到患者及其家族成員中合并自身免疫性疾病比率較高，常見的有甲狀腺炎，甲狀腺機能亢進或減退，糖尿病，慢性腎上腺機能減退，惡性貧血，風濕性關節炎，惡性黑色素瘤等，而白癜風患者的血清中，有人檢出多種器官的特異性抗體，如抗甲狀腺抗體，抗胃壁細胞抗體，抗腎上腺抗體，抗甲狀旁腺抗體，抗平滑肌抗體等，而且檢出率明顯高，另外患自身免疫性疾病者，白癜風發病率較一般人群高10～15倍，近來又發現白癜風病人有抗黑素細胞表面抗原的抗體，稱為白癜風抗體，其滴度與患者皮膚色素脫失程度有關，滴度隨皮損面積擴大而增加，還發現患白癜風的動物也有類似現象，提出該病是黑素細胞的自身免疫性疾病，Behl(1977)發現在進行期白斑邊緣有單核細胞聚集，侵入真皮表皮交界處，由破壞的基底膜進入表皮，使該處的黑素細胞及黑素缺如，認為本病可能是遲發超敏反應的自身免疫性疾病，另外，內服或外用皮質激素，特別是不按皮節分布的皮損療效較好，也間接證明本病的免疫機理。

白癜風的基本病變是表皮黑素細胞部分或完全喪失功能，Lerner1971年提出這一學說，認為白癜風是因其表皮黑素細胞機能亢進，促之耗損而早期衰退，并可能是由于細胞本身合成的毒性黑素前身物質的積聚所致，實驗證明某些化學物質對黑素細胞有選擇性的破壞作用，使皮膚脫色，這些物質多屬取代酚類化學物質的脫色劑，如氫醌單苯醚，氫醌，敘丁酚，雙氧水等，都對皮膚與毛發有脫色作用，白癜風近年來發病有所增加，可能與工業的發展，接觸這類化學物質的機會增加有關。

白癜風的發病學說較多，且均有一定依據，但又都有一定的片面性，目前認為其發病是有遺傳因素，又在多種內，外因子作用下，免疫功能，神經與內分泌，代謝功能等多方面機能紊亂，致使酶系統的抑制或黑素細胞的破壞或黑素形成的障礙，而致皮膚色素脫失。