在早期，多數患者一般無癥狀。損害大小及形狀不等，可僅為數個，亦可為多數針頭樣大的損害。在陰肛部可長成大的腫瘤樣物，有壓迫感;有惡臭味;有時小的生殖器皰疹可出現陰部痛癢不適，病人可出現尿血和排尿困難;直腸內生殖器皰疹可發生疼痛、便血，而直腸內大的生殖器皰疹則可引起里急后重感。在皰疹活動期，應少食辛辣油膩食品，因為生殖器皰疹活動期的皮損表現屬于中醫學中的熱證，而辛辣之品有助熱發散的作用，可以加重局部癥狀；在病毒靜止期，可以多進食一些富含蛋白質和維生素的食品，并且鍛煉身體，以增強體質，增強免疫力，減少復發。在生殖器皰疹急性期還要適當休息。

生殖性皰疹潛伏期短，早期沒有典型臨床癥狀，不容易被發現。生殖器瘙癢已經僅有的癥狀，后期紅疹數目增多后，瘙癢癥狀更為明顯。數日后，紅疹變為水皰，潰破、糜爛，流出膿性液體，侵及其他位置，又再起紅疹。紅疹變為水皰，結痂后疾病即康復。生殖器皰疹患者可以選擇相應的藥物來治療，藥物可以在一定程度上緩解或改善不適癥狀。在治療期間，患者不要吃芹菜、干姜、八角、桂皮、韭菜、大蒜等辛辣食物，不要吃炸薯條、炸雞翅、炸蝦、炸面包等煎炸食物，不要吃肥肉、臘腸、動物內臟、奶酪等肥膩食物。

生殖器皰疹在早期，會出現錐狀小肉粒小丘疹，一般發生在外生殖器、肛周，多數是粉紅色、菜花狀，其表面很脆，用手很容易弄掉，同時也是很容易出血及感染。皮膚表面出現米粒大小的疣體，會隨時間增長，可達到直徑10多公分，而且生長迅速，有的會像菜花大小。生殖器皰疹患者可以選擇相應的藥物來治療，藥物可以在一定程度上緩解或改善不適癥狀。在治療期間，患者不要吃芹菜、干姜、八角、桂皮、韭菜、大蒜等辛辣食物，不要吃炸薯條、炸雞翅、炸蝦、炸面包等煎炸食物，不要吃肥肉、臘腸、動物內臟、奶酪等肥膩食物。