最初患者有一些灼痛的感覺，隨著病情的發展會在之前紅斑的地方長出小水皰而且是成群狀。男人多在包皮、龜頭、冠狀溝、陰莖等部位，有時候也出當下尿道及其周邊口。女人患者的小水皰多見于陰唇、宮頸、陰蒂、陰道等地方。這些水皰逐漸化膿，初步時間后破潰，從而形成糜爛或者較淺的潰瘍。這些發生在尿道的時候，多伴有疼痛、排尿困難等癥狀。

生殖器皰疹具有潛伏期，一般來說，大約是在3～14天左右，平均大約是在6天。主要的發病部位就是龜頭、冠狀溝、包皮、陰莖；而對于女性的生殖器皰疹疾病來說，最常見的癥狀就是外陰、宮頸、肛周及臀部，主要的表現形式就是粟粒大丘疹、水皰，可彼此融合成片。除此之外，患者也還會出現一定程度上的排尿異常。

治療生殖器皰疹，需要患者改掉以前的飲食習慣，注意一些辛辣的食物盡量少吃，在生活中，如果患者比較喜歡吃辛辣刺激性食物，一定要改變自己的飲食習慣。生姜、辣椒、羊肉、牛肉及煎炸食物等辛辣溫熱之品，食后易助火生熱，中醫認為，本病為濕熱火毒蘊結肌膚所生，故皰疹患者應忌食上述辛辣食品。