選擇用藥物治療癲癇病的時候需要注意的問題包括： 第一是：選擇抗癲癇病藥物時，醫生應按照患者的癲癇發作類型選擇藥物。要注意到每種藥物的適應證和特征，以及和其他藥物共同使用是否會發生不良反應。 第二是：治療癲癇是需要長期用藥的，考慮藥物的價格問題，因此用藥還是以單一藥物為主，還可以減小藥物的毒性，避免患者發生藥物中毒。 第三是：在確認某種抗癲癇藥物對患者無效時，要更換其他藥物，換藥需要循序漸進，宜遞減舊藥和遞增新藥，以免新藥的功效還未起效舊藥就突停造成癲癇的發作。 第四是：一般2至4年沒有發作的患者可以減藥或是停藥，不過還要根據患者腦部損害的體征，發作類型及頻率等綜合來進行。

如明確病因及發作類型但服藥沒效果：藥物只能控制癲癇發作，而不能修復受損異常放電細胞，這個是導致用藥無效的根本原因。如果病因以及發作類型不明確，那么患者需先明確分型及誘因以后再進行系統規范的治療，因為癲癇有30多個分型10幾種發病誘因，分型及病因不同治療方案也會有差異。但是藥物治療治標不治本，不能排除長期服藥給身體所帶來的一系列問題。